【WordPress】ソースコード最適化プラグイン入れたら必要なJSが無効化されてた

このサイトですが、ソースコードなどを最適化するAutoptimizeというプラグインを使用しています。最近、記事の中に記述されたソースコードをいい感じにハイライトしてくれるhighlight.jsを使用しようと思い、

で記事をアップしたのですが、なぜか本番環境になるとハイライトされなくなる事態が発生。開発者ツールでエラーを調べると
「Uncaught ReferenceError:○○ is not defined」
※○○はhighlight.jsの関数名
との表示。
ローカルとプレビューでは表示されていたので定義などのエラーとも考えにくく、本番の状態のみで稼働しているものが悪さをしていると推測。
それでたどり着いたのがソースコード最適化プラグインの「Autoptimize」でした。